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組織圖 數位人文學專題研究室 資訊室 秘書室 會計室 事務室 所長 副所長 學術諮詢委員會 傅斯年圖書館 歷史文物陳列館 行政事務 出版品編輯委員會 歷史學門 考古學門 人類學們 文字學門 文化思想史研究室 法律史研究室 文物圖象研究室 禮俗宗教研究室 生命醫療史研究室 台灣與東南亞考古學研究室 世界史研究室 古代文明研究室 明清檔案工作室 地理資訊系統工作室 金文工作室 安陽工作室 科技考古實驗室

組織圖說明:
第一層:所務會議、學術諮詢委員會
第二層:所長
第三層:副所長
1. 學術發展委員會
 1-1 歷史學門
 1-2 考古學門
 1-3 人類學門
 1-4 文字學門
 1-5 專題研究室及工作室
  1-1-1 文化思想史研究室
  1-1-2 法律史研究室
  1-1-3 臺灣與東南亞考古學研究室
  1-1-4 文物圖象研究室
  1-1-5 生命醫療史研究室
  1-1-6 禮俗宗教研究室
  1-1-7 世界史研究室
  1-1-8 古代文明研究室
  1-1-9 數位人文學研究室
  1-1-10 明清檔案工作室
  1-1-11 漢籍資料庫工作室
  1-1-12 地理資訊系統工作室
  1-1-13 金文工作室
  1-1-14 安陽工作室
  1-1-15 科技考古實驗室
  1-1-16 文物維護實驗室
2. 編輯出版部(出版品編輯委員會)
3. 四館
 3-1 傅斯年圖書館(圖書館委員會)
 3-2 歷史文物陳列館
 3-3 臺灣考古館
 3-4 檔案館(檔案館委員會)
4. 行政事務
 4-1 事務室
 4-2 秘書室
 4-3 會計室
 4-4 資訊室(資訊委員會)
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